某日，双叶幼稚园的孩子们正在船屋里愉快的玩耍，一位名叫美色（三石琴乃 配音）的神秘人物忽然现身，紧接着，一艘巨大的飞船将船屋整个抓了起来，来不及逃跑的风间（真柴摩利 配音）和小新（矢岛晶子 配音）等人和飞船一起消失在了空中…

未来人歇鲁跑到日本的战国时代改变了历史，时空巡逻队铃可发现了异状，没想到在时光隧道中遭受到攻击，掉进二十世纪的小新家。铃可向野原一家求救，于是野原一家踏上时光之旅回到战国时代。

秘密的SML组织为了维护世界和平,阻止邪恶的黑道组织-猪蹄组征服世界的诡计,派特工美色潜入邪恶组织,偷取执行计划的核心元件。

动感超人的动感石头被泳装魔王抢走了，无法回到原来的世界，于是指派小新一家人成为动感战士前往另一个世界，这时另一个世界的人纷纷被变成泳装人，他和动感超人能打败魔王挽救地球的和平吗。

蜡笔小新-黑暗珠珠大追击

突然出现在野原家面前的时间和空间调查员,说时空发生了扭曲,不应存在的怪兽从怪兽的世界进入了现实世界.怪兽出现3分钟后,3分钟后的未来那个怪兽不被打倒,在现实里怪兽要出现.

蜡笔小新剧场版（也叫电影版）指东宝公司从1993开始每年发行一部电影版蜡笔小新故事。在原作者臼井仪人逝世后曾一度传言2009年为最后一部剧场版（后被澄清）按惯例每年4月份上映。

有一天,野原一家人去冲绳旅游.旅游途中小白的PP竟粘上了“只有屁股星人“不小心遗失在地球上的炸弹.